В ремастер добавили новые пролог и эпилог c героями из Pikmin и Pikmin 2, а также дополнительные подсказки и уровни сложности. Кроме того, в игре улучшили систему наведения и переработали противников.
В переиздание ввели несколько новых режимов — для двух игроков на одной консоли, соревновательный Bingo Battle и Mission Mode, в котором можно пройти все DLC оригинальной игры.
